L'importance du microbiote dans les vignobles et la production de vin

Comprendre le concept d'holobionte, le microbiote et le terroir

Une flore intestinale saine est essentielle pour éviter les sensations de ballonnement ou de constipation. On dit souvent que l'intestin est notre deuxième cerveau car le microbiote qui y est présent produit des neurotransmetteurs liés à l'humeur. De même, il est crucial pour maintenir une bonne immunité et prévenir les maladies. Il est intéressant de noter que cela n'est pas seulement vrai pour les humains, mais aussi pour les vignobles. Bien que les vignobles n'aient pas d'intestins, ils contiennent des micro-organismes importants, essentiels à leur santé.

Dans cet article, nous aborderons des concepts techniques tels que l'holobiont, le microbiote et le microbiome, qui sont essentiels à la compréhension du monde du vin et à l'appréciation d'un verre de vin. Poursuivez votre lecture si vous souhaitez en savoir plus à leur sujet.

Commençons par la plante

La vigne est une plante holobionte. Mais qu'est-ce que cela signifie ? Vous n'avez peut-être jamais entendu ce terme associé au vin, mais il est bon de le comprendre.

Le terme "holobiont" fait référence au fait que cette plante est un supra-organisme, composé de communautés microbiennes, telles que des bactéries, des champignons et des virus, qui interagissent entre elles et avec la vigne. Le terme a été introduit par Lynn Margulis et est dérivé des mots grecs "holos", qui signifie "entier", et "bios", qui signifie "organisme". Il est utilisé pour définir l'association d'un macro-organisme (tel qu'un être humain, un animal ou une plante) et des micro-organismes symbiotiques qui composent son microbiote. En effet, nous sommes nous aussi un organisme holobiont composé de millions de micro-organismes. Mais concentrons-nous sur les micro-organismes présents dans les vignobles.

Ces micro-organismes peuvent réguler des fonctions essentielles de la plante comme l'immunité, la composition microbienne doit donc toujours être équilibrée pour que la plante soit en bonne santé. À l'inverse, un déséquilibre des populations microbiennes peut entraîner une détérioration de la plante.

Ce concept repose sur quatre axiomes:

  • Tous les animaux et toutes les plantes établissent des relations symbiotiques avec des micro-organismes.
  • Les micro-organismes symbiotiques se transmettent de génération en génération.
  • L'association hôte-symbionte affecte l'aptitude de l'holobionte dans son environnement.
  • Les variations de l'hologénome résultent de changements dans les génomes de l'hôte ou du microbiote.

Pour que la plante soit en bonne santé, comme nous l'avons déjà mentionné, il faut maintenir l'équilibre du microbiote végétal, qui comprend des microorganismes eucaryotes et procaryotes, ainsi que des virus. Le microbiote de la vigne existe à l'état latent et actif dans tous les organes de la plante, des racines aux parties aériennes. Dans des conditions de stress, cette communauté symbiotique peut se déséquilibrer et causer des problèmes dans le vignoble.

Quelles sont les propriétés bénéfiques de ces micro-organismes ?

Parmi les micro-organismes présents dans les tissus de la vigne, certains sont bénéfiques, d'autres sont pathogènes et d'autres encore sont neutres dans leurs interactions avec l'hôte. Si l'on considère le concept d'holobionte, on peut supposer que la santé des plantes est intimement liée aux interactions entre la plante et son microbiote, à l'instar du règne animal.

L'identification d'agents bénéfiques a permis de concevoir des stratégies de protection de la vigne telles que la biofertilisation, le biocontrôle (capacité à éliminer les pathogènes) ou la biostimulation (capacité à synthétiser des composés favorisant la croissance). Parmi les groupes microbiens bénéfiques, on peut citer les bactéries favorisant la croissance des plantes et les champignons mycorhiziens à arbuscules.

Ces bactéries qui favorisent la croissance des plantes peuvent solubiliser des formes de phosphore qui, autrement, ne seraient pas disponibles pour la vigne. D'autre part, les champignons mycorhiziens à arbuscules augmentent la capacité d'absorption de l'eau par la plante, ce qui améliore la tolérance au stress hydrique et à la carence en fer ou à la salinité du sol.

Exploration d'un autre terme : Le microbiome, à l'origine d'une grande variété de vins

Le microbiome désigne la communauté de micro-organismes (tels que les champignons, les bactéries et les virus) qui existent dans un environnement particulier. Plus techniquement, il s'agit de l'ensemble des gènes apportés par les microbes qui forment le microbiote au sein d'un holobiont.

L'environnement et les différentes techniques de vinification, telles que la fertilisation, la taille, les types de sol ou les climats, donnent des vins aux caractéristiques organoleptiques différentes. Celles-ci dépendent également du processus de vinification, de la flore microbienne associée au vignoble et de l'emplacement du vignoble. C'est là qu'intervient la notion de "terroir".

Qu'est-ce que le terroir ?

Le terroir est un terme qu'il est souvent difficile d'exprimer clairement. Il englobe les paramètres biotiques et abiotiques d'une région spécifique pour expliquer la production d'un vin unique. Il n'est pas facile de le définir en quelques mots, car il comprend de nombreux facteurs, notamment

  • La température ou l'humidité.
  • La latitude et l'altitude.
  • L'orientation et la pente.
  • La composition du sol.
  • La microflore.

Par conséquent, la définition du terroir implique également la caractérisation des micro-organismes associés, car les levures naturellement présentes dans le raisin dans le vignoble, dans l'environnement du chai, ou inoculées avant le processus de fermentation, ont un impact significatif sur les caractéristiques finales des vins. Le microbiote du raisin varie en fonction des variations du microclimat et des ressources nutritionnelles disponibles.

Comme vous pouvez le constater, les micro-organismes présents dans les vignobles sont importants à la fois pour la santé de la plante et pour l'obtention de différentes caractéristiques organoleptiques dans les vins. Un bon terroir est au vin ce qu'une bonne alimentation est à l'homme.

En conclusion, il est essentiel de comprendre les concepts d'holobiont, de microbiote, de microbiome et de terroir pour apprécier les subtilités de la production vinicole et savourer pleinement un verre de vin. Le maintien d'un microbiote équilibré est non seulement essentiel pour la santé humaine, mais aussi pour la santé des vignes et la qualité des vins qu'elles produisent.